DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5'碳位共价键结合一个甲基基团。850K甲基化芯片包含>850,000个CpGs位点信息,分布于增强子、基因编码区、启动子区和 CpG 岛。相比较于全基因组甲基化检测,该芯片周期短、价格低,并可以接受 FFPE 样本。
DNA甲基化图谱制作、疾病关联分析、基因调控分析、疾病的甲基化标志物筛选。
常规1.5 μg,最低仅需500 ng
标准分析 |
|
高级分析 |
|
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing),基于高通量测序的染色质可及性研究。在核小体连接致密的地方,转座酶不能进入,而松散的区域,转座酶能够进入并切割下暴露的DNA区域,并同时连接上特异性的接头,有接头的DNA片段被分离出来,用于高通量测序。因此,ATAC-seq可以得到全基因度范围上处于开放状态的染色质区域,并且通过分析染色质开放区域的序列特征(motif),可以获得潜在的活跃转录因子结合区域及其靶基因。
适用于从表观角度研究调控机制的方向、开放染色质图谱、核小体定位、转录因子结合位点分析、预测疾病分子标志物、疾病发病机制。
组织样本>100 mg/样本 细胞样本>5x105/样本
标准分析 |
|
个性化分析 |
|
WGBS(Whole Genome Bisulfite Sequencing)全基因组甲基化测序,是将基因组DNA进行Bisulfite(亚硫酸盐)处理后构建测序文库,并进行二代高通量测序的技术,通过分析获得全基因范围上的甲基化碱基修饰信息。
全基因组甲基化图谱构建、基因表观调控研究。
样品类型:组织样本(>50mg)或者DNA 样品;
样品需求量:DNA总量≥1ug,浓度≥50ng/μL;
样品完整性:DNA 无明显降解,需提供凝胶电泳检测胶图。
标准分析 |
|
个性化分析 |
|