产品介绍

单细胞转录组测序是将组织样本制备成细胞悬液后，对样本中每个细胞的转录组进行测序，能够获得每个细胞的基因表达特征，从而利用表达特征信息精细区分细胞类型，发现罕见稀有细胞亚型，深入系统的研究细胞间的相互作用关系，揭示组织中细胞群体的异质性，全面完整地了解生物进程。


适用范围

细胞图谱绘制、发育生物学（胚胎、神经、脑等各种组织）、肿瘤微环境与抗药机制研究、干细胞分化潜能研究、免疫方向。


样本要求

样本类型 外观要求 样本量 接收标准 运输条件 运输时间
组织 容器无破裂、开盖;样本无泄漏、无外溢 ≥100mg 新鲜组织样本 2-8℃ <72h
新鲜血（EDTA） ≥5ml 无溶血现象 2-8℃ <1周
PBMC样本 细胞数≥5x105 活性≥90% 体积≥500ul -80℃ <1周
细胞悬液 细胞数≥5x105 活性≥90% 体积≥ 500ul -80℃ <1周
穿刺样本 ≥3条 新鲜穿刺样本 2-8℃ 72h


产品流程



分析内容

标准分析
  1. 数据质控与评估：样本数据量统计及质控、比对基因组、基因表达定量；
  2. 单细胞亚群分类与分类结果可视化：细胞过滤、细胞亚群分类、分类结果可视化（Umap图）；
  3. 亚群上调表达基因分析：上调表达基因筛选、上调基因表达分布分析、上调表达基因能富集分析；
  4. 单细胞亚群singleR数据库注释；
  5. 细胞周期分析。
个性化分析
  1. 细胞亚群拟时分析；
  2. 细胞通讯分析；
  3. 细胞转录因子分析；
  4. 单细胞CNV分析；


产品介绍

ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing）染色质可及性高通量测序，是基于Tn5 转座酶对开放染色质区域进行切割并插入测序接头，最终通过测序数据来推断染色质开放区域的特性的研究。单细胞ATAC-seq基于10x genomics平台的微流控和油滴包裹技术在单细胞水平对染色质的开放区域进行检测并分析，获得细胞类型和状态的信息，并深入了解基因调控机制。


适用范围

构建单细胞染色质开放性图谱、发现表观遗传变异引起的细胞异质性、构建基因表达上游的基因调控网络、预测疾病分子标志物


样本要求

样本类型 外观要求 样本量 接收标准 运输条件 运输时间
组织 容器无破裂、开盖;样本无泄漏、无外溢 ≥100mg 新鲜组织样本；冰冻保存样本 -80℃ <72h
新鲜血（EDTA） ≥5ml 无严重溶血 2-8℃ <72h
PBMC样本 细胞数≥5x105 体积≥500ul -80℃ <1周
细胞悬液 细胞数≥5x105 体积≥ 500ul -80℃ <1周
穿刺样本 ≥3条 新鲜穿刺样本 -80℃ 72h


产品流程



分析内容

标准分析
  1. 样本数据统计与质控；
  2. 比对基因组分析；
  3. Peak分析：peak信息统计、TSS周围信号分布、peak区域片段分布统计；
  4. 单细胞亚群分类与分类结果可视化；
  5. Peak注释：peak相关基因注释、peak相关基因功能富集分析；
  6. peak 序列motif分析及TF motif富集分析；
  7. 亚群染色质易接近性差异分析，以及差异peak相关基因功能富集分析。
个性化分析
  1. 与10x单细胞转录组数据关联分析；


产品介绍

T/B细胞是机体适应性免疫系统的两大细胞群，细胞表面受体TCR（T cell receptor）/BCR （T cell receptor）是免疫细胞的重要标志物。TCR/BCR存在一块区域叫互补决定区（ComplementaryDetermining Region, CDR），由CDR1、CDR2、CDR3三个部分组成，其中CDR3最高变，在"异已"的抗原识别中起关键作用。盘古医学依托新格元公司自主研发的微流控芯片技术，采用靶向TCR/BCR 恒定区的分子探针，能特异性捕获TCR/BCR mRNA分子，有效提高TCR/BCR的mRNA分子捕获效率。


适用范围

只适用于人的研究，肿瘤研究（肿瘤免疫治疗研究，肿瘤免疫微环境研究）、免疫疾病研究（biomarker筛选）、抗体评估（群体免疫反应评估，抗体筛选）、感染疾病研究（药物作用机制研究，感染过程免疫环境动态监控）。


样本要求

样本类型 外观要求 样本量 接收标准 运输条件 运输时间
组织 容器无破裂、开盖;样本无泄漏、无外溢 ≥100mg 新鲜组织样本 2-8℃ <72h
新鲜血（EDTA） ≥5ml 无严重溶血 2-8℃ <1周
PBMC样本 细胞数≥5x105 活性≥90% 体积≥500ul -80℃ <1周
细胞悬液 细胞数≥5x105 活性≥90% 体积≥ 500ul -80℃ <1周
穿刺样本 ≥3条 新鲜穿刺样本 2-8℃ 72h


产品流程



分析内容

标准分析
  1. 样本数据统计与质控；
  2. 比对基因组分析；
  3. CDR3特征分析；
  4. V-J 配对特征分析。
个性化分析
  1. 与10x单细胞转录组数据关联分析；


更新中

更新中