产品介绍

扩增子测序是提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物对细菌(16S rDNA)、真菌(18S/ITS)、功能基因等的DNA片段进行特定长度的PCR扩增并对扩增产物进行测序,分析序列中的变异。通过检测目标区域的序列变异和丰度,解析微生物在种属水平上的组成和丰度情况,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。


适用范围

疾病诊断、治疗,微生物-宿主关联机制等医学领域。


样本要求

粪便:3-5 g

血液:10 mL

DNA:总量 ≥200ng、浓度 ≥20 ng/μL、1.8 < OD260/280 < 2.0



产品流程



分析内容

标准分析
  1. 物种注释及各物种丰度信息;
  2. α-多样性分析和微生物群落丰富度;
  3. β-多样性分析和样本间差异情况;
  4. 多元统计分析;
  5. CCA分析、环境因子关联分析、VPA分析;
  6. 功能预测。
高级分析
  1. 肠型分析肠道菌群与疾病关系;
  2. 贝叶斯网络图分析微生物、环境、代谢物之间的关系;
  3. Source Tracker分析样本中微生物群落来源。


产品介绍

宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象。宏基因组测序技术无需微生物的分离纯化培养,直接提取环境样本DNA进行测序,能够快速有效地获得整个微生物群落的基因信息,可以深入研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。


适用范围

疾病诊断、治疗,微生物-宿主关联机制等医学领域。


样本要求

样本类型 样本量 标本类型 标本量
肺泡灌洗液 ≥3 ml 腹水 ≥3 ml
血液 ≥3 ml 脓液 ≥3 ml
尿液 ≥3 ml 痰液 ≥3 ml
脑脊液 ≥3 ml 其他体液 ≥3 ml
胸液 ≥3 ml 组织 黄豆粒大小


产品流程



分析内容

标准分析
  1. 测序数据质量评估;
  2. 基因预测及相关分析;
  3. 物种、基因功能注释及相关分析;
  4. CARD耐药基因相关分析;
  5. CAG/MLG疾病和菌株关联研究分析;
  6. CNV(copy number variation)菌株拷贝数变异与疾病关联研究;
  7. 噬菌体及前噬菌体预测及分析。


应用领域

病原微生物研究

病原微生物宏基因组检测基于二代高通量测序平台,检测样本中的全部核酸序列,通过智能化算法获得致病微生物的种属信息,明确感染病因。该检测具有无偏倚性、广覆盖、快速等优点,可以在临床研究中快速明确感染性疾病的病原体,进一步辅助临床医生制定精准诊疗方案和指导靶向用药。

宏基因组检测病原微生物种类

临床研究适应病症

采用多组学联合分析,宿主、病原体联合分析策略,拥有完整的病原体数据库。适用于呼吸科、感染科、ICU、儿科、消化科等临床科室感染性疾病研究。尤其适用于呼吸系统、中枢神经系统和血液系统等发生的感染性疾病等发生的感染


宏基因组检测病原微生物感染患者类型



盘古宏基因组优势